トップページはきちんと表示されるのに個別記事は「何も見つかりません」と出て表示されなくなっていました。記憶が定かではありませんがプラグインを入れてからこうなったように思います。しかしプラグインを外しても元に戻らず何でこうなってしまったかはいまだにわかりません。
応急措置として以下のページのようにやってみたら表示されるようになったのですが、
wordpressパーマリンク設定後に記事が表示されない時の対策
これだとカテゴリページのUrlが変わってしまうのでWordPressを丸ごと再インストールしたほうがいいかなぁ。面倒だけど。